Mokuton entsteht daurch, dass Doton als Anhydrid für Wasser ist. Dieses Element gehört nicht zu den Hauptelementen. Das Holzelement ist ein Kekkei Genkai welches nur der Erste Hokage beherrscht. Außerdem kann Yamato (Tenzou) dieses Element nutzen, da dieser Zellen des Ersten Hokage eingepflanzt bekam. Alle auf Holz basierenden Jutsu gehören diesem Element an.


Beispiele für Mokuton:


  
Mokuton: Shichuuka no Jutsu      Mokuton Hijutsu: Jukai Koutan     Moku Bunshin no Jutsu